特色功能
1. 自动生成误差条:输入重复样本的数据后,软件自动计算并在统计图上生成误差条,而不需要人为操作。
2. 同时分析多个相关实验的数据。
3. 分析重复实验的效率高:任何一次分析都可以作为其重复实验的模板,导入重复实验的数据后。
4.软件自动进行数据分析并作图。
5. 修正输入的数据,软件能自动对其分析结果和统计图进行同步修正。

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软件亮点
一、更高维度的数据!
Prism 9对多变量数据表进行了许多重大改进。使用标准结构探索更大的数据集,并通过以下改进执行新的和改进的分析:
1、增加的数据限制-在每个数据表中最多输入1024列数据
2、自动识别变量类型-将多变量数据表中的变量识别为连续值,分类值或标签值
3、数据表中的文本信息-直接以文本形式输入数据。无需编码“ 0”和“ 1”之类的变量,只需直接在数据表中输入“ Male”和“ Female”
4、自动变量编码-输入您的数据,让Prism负责其余的工作。Prism会自动将分类文本变量编码为数字“虚拟”变量
二、主成分分析(PCA)
有时,收集的变量数量远远超过可供研究的学科数量。考虑基因表达研究,其中从分为两组的受试者中测量了成百上千种不同基因的表达水平:治疗组和对照组。可能仅仅是变量太多而无法使模型适合数据。但是,选择一些要从分析中排除的变量只会丢掉可能有用的信息!PCA是一种“降维”技术,可用于减少所需变量的数量,同时从数据中消除尽可能少的信息。
PCA中可用的其他功能包括:
1、通过平行分析(以及Kaiser方法,总方差阈值方法等)选择组件
2、碎石图,分数图和双线图的生成
3、自动准备PCA结果以进一步用于多元线性回归(主成分回归)
三、向图形添加新尺寸
直接从原始数据,符号位置(X和Y坐标),大小和填充颜色的编码变量创建气泡图。请注意,可以使用分类(分组)或连续变量来定义符号颜色和符号大小。
在此图上,超过100个国家/地区显示为单个圆圈。每个圆圈的X坐标代表该国的GDP(PPP),而Y坐标代表出生时的平均预期寿命。每个符号的大小与其所代表的国家的人口成比例(两个最大的符号分别代表中国和印度)。最后,每个符号的颜色代表该国家所在的大陆。在这种情况下,此最终变量(颜色)是分类变量,但气泡图中的颜色也可以由连续变量定义:在该图中,符号的X坐标,Y坐标和大小与以前相同。但是,现在该符号的颜色连续不断地代表该国家每1000个人的出生率。棱镜现在还具有内置的半透明配色方案,以便可以更清晰地看到重叠的符号。
四、自动将多个比较结果添加到图形!
只需执行多个成对比较的适当分析即可。然后单击一次以将这些结果自动添加到图形中。要自定义这些行和星号,只需再次单击工具栏按钮。调整数据或分析,图形上显示的结果将自动更新。但是请记住,P值只是故事的一部分。别忘了报告效果估算值(例如,均值差异为95%置信区间!)
五、使用估计图更好地可视化T测试结果
在测试中执行,Prism现在将自动创建结果的估计图。在此图上,两组的原始数据都将绘制在左侧的Y轴上。在右边的Y轴上,将绘制组均值的差及其95%置信区间。该可视化提供的信息比单独的P值还多,因为它不仅显示了95%CI是否包含零(如果95%CI包含零,则P值将大于0.05;它还显示了95%CI的宽度)。如果95%CI不包括零,则P值将小于0.05)
GraphPad Prism 6功能介绍
1、新的分析-ANOVA,多重比较等
·所有因子都带有重复测量的双因子方差分析(ANOVA)。
·用于多重检验的多重性调整("精确")P值。
·新的事后检验(post tests)-Fisher无保护最小显著性差异(Least Significant Difference,LSD)和Holm-Sidak。
·立即运行一组t检验(每行一个),修正带有事后检验(Bonferroni )的多重比较或控制假阳性率(False Discovery Rate,FDR)。
·遵照带有简单或主效应的双因子方差分析。就算您不知道这意味着什么也不用担心-软件以图形化的方式呈现这些选择,因此意思是显而易见。
·在重复测量单因子方差分析中的Greenhouse-Geisser相关避免了假设球形的需要。
·Grubbs异常值探测。我们最常用的QuickCalc网页计算器现在已是Prism的一部分。
·两组比较的Kolmogorov-Smirnov检验(另外一个是Mann-Whitney检验)。
·比率t检验。
2、改善的曲线拟合
·拟合隐式和微分模型。
·编写更复杂的模型。
·更快速的插值。增加了新的分析,从标准曲线的无缝的插值过程。
·通过1/Y^k的加权。
·蒙特卡罗模拟(Monte-Carlo simulations)现在无需编写脚本。
3、饼图等
·增加一种新的数据表格,以用于整体数据的部分内容。画出饼图,甜甜圈图(donut plots)等。
·使用卡方或二项检验比较观测分布的值和理论预期值。
·计算整个列中的每个值为分数或百分比。
4、处理大数据集
·输入多达256数据集列的数据。
·输入每个数据集的多达256个子列(Prism 5中是52个)。这让您计算重复测量双因子方差分析的更多主题。
5、更有效的工作
·更快。更快保存,更快关闭,更快非参数计算,更快制图,更快屏幕重绘。
·立即格式化多列。需要以另外一列画出点线 现在只需要一步。
·直接从数据表格中选择数据点的大小,形状和颜色。您甚至能够选择任意连续数据块和选择您数据表格的特定子集。
WAND.如果您喜欢MAIG,您一定会喜欢新的WAND。当MAGIC重新格式化图形,WAND分析和图形化新的数据表格来匹配您必须对另外一个表格要执行的操作。
·从结果表格粘贴链接值到数据表格,以便自动更新内容。这也对您需要从一个表格到另一个表格链接数据时有效。
6、自定义图形和布局的更多的方法
·和其他人分享
·导出图形为更多种格式
·更好的TIFF压缩意味着更小的文件和更快的导出
·导入更多类型的图形文件到您的软件布局
·控制在软件中是否使用句号或逗号作为小数分隔符
·选择从软件数据表中导出/粘贴时如何处理排除值
·如果您使用LabArchives,现在您可以直接从LabArchives打开您的Prism文件,而不需先下载文件到您的电脑。Prism 6文件在LabArchives中是完全可搜索的。
prism6使用教程
1、折线图
折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图

在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

在Data栏中输入数据

软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图

1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图

新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

在data栏中粘贴数据,如下图

打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了

1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。

仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

将数据粘贴进去

软件即时生成的图如下图所示

折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做