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目标蛋白MRM定量分析是指基于质谱的多反应检测技术（Multiple Reaction Monitoring, MRM）。该技术本质上是一种质谱的扫描模式，基于目标蛋白的特定母离子和子离子对，选择采集符合目标离子规则的信号，去除不符合规则的信号干扰，进行高灵敏度、高准确性和特异性的靶向蛋白定量。MRM质谱分析主要包括三个阶段：（1）一级质谱扫描筛选出与目标分子特异性一致的母离子；（2）碰撞碎裂母离子，去除干扰离子；（3）只采集来自选定的特异离子的质谱信号。可以基于理论预测或者真实实验结果选择母离子对。